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自动化酵母造就+长读长RNA Seq样本造备

微生物发酵等生物工艺是生物医药、食品化工

更新功夫:2026-05-11浏览:317次

微生物发酵等生物工艺是生物医药、食品化工等领域的主题环节,而精准监测造就参数、急剧实现分子层面的转录组分析,是优化造就前提、提升工艺产出的关键。但传统尝试流程不仅耗时费劲,还难以实现高通量苹叫验证,大大拖慢了研发进度。

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好在技术的突破总能解决行业痛点!Hamilton Microlab STAR液体处置平台与 bioREACTOR 48 DS生物反映器整合,打造出一套自动化解决规划,实现了酵母平行造就、在线参数监测、RNA提取到长读长RNA-Seq文库造备的全流程自动化,大幅提升了生物工艺开发的效能和通量,为微生物造就工艺优化提供了技术支持。

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一站式整合,全流程自动化无缝衔接

这套系统的主题优势在于将发酵造就与分子检测的全流程整合在统一平台,从接种物造备到最终的测序文库构建,除少量离心、测序步骤表,其余环节均实现自动化操作,真正做到了 “一站式" 尝试。

高通量平行造就:依附 bioREACTOR 48 DS的24个微型搅拌式生物反映器(工作体积11mL),可实现多前提平行发酵,且反映器建设温度节造、溶氧(DO)和pH在线传感器,结合OD600光密度检测,实时监测生物量、溶氧、pH等关键参数,精准把控造就状态。

优先级智能调度:搭载动态优先级调度软件,可自动执行补料、pH调控、取样等工作,其中RNA-Seq样品造备工作被设为最高优先级,能与发酵过程同步进行,无需期待造就实现,大幅节俭尝试功夫。

自动化分子尝试:造就过程中触发取样后,平台会自动实现酶法细胞裂解、磁珠法总RNA提取、RNA定量归一化、cDNA文库构建等步骤,全程使用尺度化试剂盒,保障尝试的沉复性和不变性。

实战验证!酿酒酵母碳源筛选阐发亮眼

为验证系统机能,钻研团队以野生型酿酒酵母为钻研对象,评估了葡萄糖、丙酮酸、果糖、半乳糖、蔗糖、甘露糖6种碳源的造就成效,每种前提设置4个沉复,全程由该自动化平台实现尝试操作,各项数据阐发极度杰出。

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1. 造就参数监测:碳源特异性成长模式清澈出现

通过在线监测 OD600(生物量)和溶氧亏损,清澈观察到酿酒酵母在分歧碳源下的成长曲线和代谢特点差距,为后续碳源筛选和造就前提优化提供了直观的表型数据。

2. RNA 提。翰扛摺⒋慷抛

对24个样品实现自动化RNA提取后,测得中位RNA产量达245.8 ng/μL,且所有样品的A260/280均值为2.27、A260/230均值为2.54,切合高质量RNA的纯度尺度,分歧碳源组间的沉复性优良,证明自动化提取流程不变靠得住。

3. 文库构建与测序:文库产量达标,测序数据优质

经自动化归一化处置后,24个cDNA文库的中位产量达37.7 ng/μL,满足测序要求。后续MinION Mk1B测序共获得24.4M,其中Q-score>9的高质量读段21.73M,N50达918 bp,全长读段更是达到18.8M,为后续的差距基因表白分析提供了充足的优质数据。

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主题优势汇总,解锁生物工艺开发新效能

相较于传统的人为操作流程,这套整合自动化平台的优势体此刻多个方面,符合生物工艺研发的高通量、高沉复性需要:

高通量平行尝试:最多支持48个独立生物反映器并走运行,可高效发展克隆筛选、多成分DOE尝试,急剧筛选造就前提;

全程自动化操作:从发酵造就到文库造备,大幅削减人为过问,最幼化手动操作功夫,耽搁无人值守功夫,提升尝试效能的同时预防报答误差;

多参数实时监测:pH、溶氧、生物量等关键参数在线检测,精准把握造就动态,可实时触发取样和后续分子尝试;

数据衔接更顺畅:表型造就数据与转录组分子数据无缝对接,从 “造就表型" 到 “基因表白" 实现一站式分析,为生物工艺优化提供分子层面的理论支持;

流程可扩大性强:基于尺度化的液体处置平台和?榛杓,可凭据钻研需要适配分歧的微生物造就、核酸提取和文库造备规划,适配性广。

总结

Hamilton Microlab STAR与bioREACTOR 48 DS的整合规划,将高通量平行发酵与长读长RNA-Seq样品造备进行了创新性的自动化融合,不仅解决了传统生物工艺开发中通量低、流程繁琐、数据衔接不畅的问题,还为微生物造就的分子机造钻研提供了高效、不变的技术平台。

这套规划合用于生物医药、工业发酵、微生物育种等多个领域的工艺开发和基础钻研,助力钻研人员更快地筛选造就前提、解析微生物代谢调控机造,加快生物工艺的产业化转化!

 

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